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Worthington組織消化指南
引言
組織消化酶主要用于組織培養(yǎng)和細(xì)胞生物學(xué)研究的原代細(xì)胞的分離和收集。盡管這些消化酶已經(jīng)普遍應(yīng)用多年，但是對其組織消化和細(xì)胞收集的作用機制卻沒有全面的理解。 由此導(dǎo)致的結(jié)果便是選擇一種消化方法大多是隨機選擇或基于過去的經(jīng)驗，而不是在*理解消化原理的基礎(chǔ)上選擇的消化方案，以及如何根據(jù)具體實驗?zāi)康男拚桨敢垣@得更好的實驗結(jié)果。
細(xì)胞分離程序的目的是zui大程度的獲得功能活性的單個細(xì)胞，而影響結(jié)果的原因有很多，包括（不限于）以下：
1、組織類型
2、物種來源
3、動物年齡
4、遺傳改造情況（如knockouts）
5、所用的消化培養(yǎng)液
6、所用的酶
7、消化酶中的雜質(zhì)
8、所用消化酶的工作濃度
9、溫度
10、孵育時間
通常前四個原因沒辦法選擇，而剩下的原因一般由經(jīng)驗決定以獲取zui適實驗結(jié)果。
通過查閱文獻來選擇*組織消化酶和zui適消化條件的研究人員通常被互相矛盾的實驗數(shù)據(jù)搞得一頭霧水。這些巨大差異來源于組織胞外基質(zhì)的復(fù)雜而動態(tài)的特性，以及過去常用的粗制、未提純的組織分離酶。另外，組織胞外基質(zhì)由各種蛋白、糖蛋白、脂類和糖脂組成，這些成分的組成比例在不同物種、不同組織、甚至不同發(fā)育（年齡）之間存在明顯的差異，這些因素都極大的影響了消化方案的制定。目前通常使用的粗制酶，如鏈霉蛋白酶、NF1:250、以及含有幾種其他不同濃度蛋白酶的膠原酶、以及各種多糖酶、核酶和脂酶。
本指南總結(jié)了目前常用組織消化酶的zui適消化和細(xì)胞收集知識和方法，描述了標(biāo)準(zhǔn)的實驗步驟， 以便于制定一個*的細(xì)胞分離方案，同時列舉了一些相關(guān)的參考文獻。
下表列出多種組織的適宜消化酶（含參考文獻，以組織類型和物種分類，詳見鏈接）
脂肪組織 | 腎上腺組織 | 骨組織 | 腦組織 |
軟骨組織 | 結(jié)腸組織 | 內(nèi)皮組織 | 上皮組織 |
眼 | 心臟 | 腸 | 腎 |
肝 | 肺 | 淋巴結(jié) | 乳腺 |
其它組織 | 其他組織 | 肌組織 | 神經(jīng)組織 |
胰腺 | 腮腺 | 垂體 | 前列腺 |
生殖 | 動物鱗片 | 皮膚 | 脾臟 |
干細(xì)胞 | 胸腺 | 甲狀腺/甲狀旁腺 | 扁桃體 |
腫瘤 |
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注：使用Worthington公司消化酶的文獻不限于上表鏈接中所列，一般而言，Worthington公司的組織消化酶可用于大多組織類型的消化。
脾臟組織消化手冊
| 物種 | 詳細(xì)來源 | 細(xì)胞名稱 | 消化用酶 | 培養(yǎng)基 | 參考文獻 |
| 小鼠 | 小鼠 | Splenic | Collagenase Type 2: 0.1% | PBS | Klebanoff, C., Spencer, S., Torabi-Parizi, P., Grainger, J., Roychoudhuri, R., Ji, Y., Sukumar, M., Muranski, P., Scott, C., Hall, J., Ferreyra, G., Leonardi, A., Borman, Z. et al.: Retinoic Acid Controls the Homeostasis of Pre-cDC-Derived Splenic and Intestinal Dendritic Cells., J Exp Med 210, 1961, 2013 |
| 小鼠 | 小鼠 | Splenocytes | Collagenase Type 2: 0.16% | PBS | Yi, T. and Cyster, J.: EBI2-Mediated Bridging Channel Positioning Supports Splenic Dendritic Cell Homeostasis and Particulate Antigen Capture.,Elife Vol. 2,, , e00757, 2013 |
| Deoxyribonuclease I: 0.002% | |||||
| 小鼠 | 小鼠 | Spleen, bone marrow endothelial | Collagenase Type 4: 0.3-1.0% | PBS | Shi, C., Jia, T., Mendez-Ferrer, S., Hohl, T., Serbina, N., Lipuma, L., Leiner, I., Li, M., Frenette, P. and Pamer, E.: Bone Marrow Mesenchymal Stem and Progenitor Cells Induce Monocyte Emigration in Response to Circulating Toll-Like Receptor Ligands., Immunity 34, 590, 2011 |
| Deoxyribonuclease I: 20 u/ml | |||||
| 小鼠 | 小鼠, 雌性, 6-8 week | Dendritic | Collagenase Type 4: 0.05% | RPMI 1640 | Abou Fakher, F., Rachinel, N., Klimczak, M., Louis, J. and Doyen, N.: TLR9-Dependent Activation of Dendritic Cells by DNA from Leishmania Major Favors Th1 Cell Development and the Resolution of Lesions., J Immunol 182, 1386, 2009 |
| 小鼠 | 小鼠 | Dendritic | Collagenase Type 1: 0.5% | HBSS | Flano, E., Jewell, N., Durbin, R. and Durbin, J.: Methods Used to Study Respiratory Virus Infection.,Curr Protoc Cell Biol Vol. Chapter 26,, , Unit 26.3, 2009 |
| 小鼠 | 小鼠 | Dentritic | Collagenase: 300 u/ml | RPMI 1640 | Abe, K., Nguyen, K., Fine, S., Mo, J., Shen, C., Shenouda, S., Corr, M., Jung, S., Lee, J., Eckmann, L. and Raz, E.: Conventional Dendritic Cells Regulate the Outcome of Colonic Inflammation Independently of T Cells., Proc Natl Acad Sci U S A 104, 17022, 2007 |
| Deoxyribonuclease I: 0.002% | |||||
| 小鼠 | 小鼠 | Splenic | Collagenase Type 2: 0.1% | RPMI | Mueller, S., Matloubian, M., Clemens, D, Sharpe, A., Freeman, G., Gangappa, S., Larsen, C. and Ahmed, R.: Viral Targeting of Fibroblastic Reticular Cells Contributes to Immunosuppression and Persistence During Chronic Infection., Proc Natl Acad Sci U S A 104, 15430, 2007 |
| Deoxyribonuclease I: 0.1% | |||||
| 小鼠 | 小鼠 | Splenic stromal | Collagenase Type 3: 100-400 u/ml | HBSS | Benedict Chris A, De Trez Carl, Schneider Kirsten, Ha Sukwon, Patterson Ginelle, Ware Carl F:Specific remodeling of splenic architecture by cytomegalovirus, PLoS Pathog 2, e16, 2006 |
| 小鼠 | 小鼠 | Leukocytes | Collagenase Type 4: 43 u/ml | RPMI 1640 | Siragam, V., Crow, A., Brinc, D., Song, S., Freedman, J. and Lazarus, A.: Intravenous Immunoglobulin Ameliorates ITP via Activating Fc Gamma Receptors on Dendritic Cells., Nat Med 12, 688, 2006 |
| 小鼠 | 小鼠, 4-6 周 | Dentritic | Collagenase Type 1: 0.1% | RPMI-1640 | McLellan AlexanderD, Kapp Michaela, Eggert Andreas, Linden Christian, Bommhardt Ursula, Br枚cker Eva-B, K盲mmerer Ulrike, K盲mpgen Eckhart: Anatomic location and T-cell stimulatory functions of mouse dendritic cell subsets defined by CD4 and CD8 expression, Blood 99, 2084-93, 2002 |
| Deoxyribonuclease I: 0.001% | |||||
| 小鼠 | 小鼠 | Dentritic | Collagenase Type 3: 0.1% | RPMI 1640 | Schiavoni, F, Mattei, F, Sestili, P, Borghi, P, Venditti, M, Morse, H, Belardelli, F, and Gabrieli, L:ICSBP is Essential for the Development of Mouse Type I Interferon-producing Cells and for the Generation and Activation of CD8a+ Dendritic Cells, J Exp Med 196, 1415, 2002 |
| Deoxyribonuclease I: 325 u/ml | |||||
| 小鼠 | 小鼠 | Dentritic | Collagenase: 100 u/ml | HBSS | Brasel K, De Smedt T, Smith JL, Maliszewski CR: Generation of murine dendritic cells from flt3-ligand-supplemented bone marrow cultures, Blood 96, 3029-39, 2000 |
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