TriLink提供了一個(gè)3'iCLIP底漆，用于iCLIP應(yīng)用程序。紫外線交聯(lián)免疫沉淀（CLIP）是一種闡明RNA與蛋白質(zhì)相互作用的強(qiáng)大技術(shù)。標(biāo)準(zhǔn)協(xié)議通常采用標(biāo)記的銜接子來(lái)可視化蛋白質(zhì)-RNA復(fù)合物。該方法涉及RNA與蛋白質(zhì)的不可逆交聯(lián)，免疫沉淀，5'和3'銜接子的連接，逆轉(zhuǎn)錄，后是PCR擴(kuò)增。不幸的是，逆轉(zhuǎn)錄酶無(wú)法讀取交聯(lián)區(qū)域，這會(huì)產(chǎn)生截短的cDNA，而沒(méi)有啟動(dòng)PCR擴(kuò)增所需的3'和5'銜接子。
CLIP方法的一種變化，單個(gè)核苷酸分辨率的UV交聯(lián)和免疫沉淀（iCLIP）通過(guò)使用預(yù)腺苷酸化引物（iCLIP引物）和逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的環(huán)化來(lái)解決此問(wèn)題。該方法也將結(jié)合位點(diǎn)解析為各個(gè)核苷酸，并提高了位于重復(fù)基序內(nèi)的結(jié)合位點(diǎn)的準(zhǔn)確性。
trilinkbiotech免疫沉淀產(chǎn)品
3' iCLIP Primer
Cat #: O-30050
| SKU | Unit Size |
|---|---|
| O-30050-03 | 3 nmole |
| O-30050-09 | 3 x 3 nmole |
PO DNA，5'（rApp）AGA TCG GAA GAG CGG TTC AG（ddC）3'UV交聯(lián)和免疫沉淀（CLIP）的開(kāi)發(fā)可鑒定RNA-蛋白質(zhì)相互作用（Ule J等，2003）。該方法涉及RNA與蛋白質(zhì)的不可逆交聯(lián)，免疫沉淀，5'和3'銜接子的連接，逆轉(zhuǎn)錄以及后的PCR擴(kuò)增。不幸的是，CLIP受到限制，因?yàn)槟孓D(zhuǎn)錄酶無(wú)法讀取交聯(lián)區(qū)域。這樣就創(chuàng)建了不需要啟動(dòng)PCR擴(kuò)增所需的3'和5'銜接子的截短的cDNA。雖然存在多種CLIP方法版本，但單個(gè)核苷酸分辨率的UV交聯(lián)和免疫沉淀（iCLIP）具有許多優(yōu)勢(shì)。iCLIP解決了截短cDNA擴(kuò)增差的問(wèn)題。這可以通過(guò)使用預(yù)腺苷酸化引物（iCLIP引物）和逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的環(huán)化來(lái)實(shí)現(xiàn)。該方法還解析了與單個(gè)核苷酸的結(jié)合位點(diǎn)，并提高了位于重復(fù)基序內(nèi)的結(jié)合位點(diǎn)的準(zhǔn)確性（Konig J et al。2010.，Konig J et al。2011）。
| 貨號(hào) | O-30050 |
|---|---|
| 質(zhì)量控制 | 通過(guò) |
| 骨干 | 磷酸二酯 |
| 序列 | 5（rApp）AGA TCG GAA GAG CGG TTC AG（ddC）3 |
| 推薦儲(chǔ)存 | -20°C以下 |
| 應(yīng)用 | 下一代測(cè)序（NGS） |
